設置於竹南台南二處,主要功能區域為小動物飼養與實驗操作區、生物安全等級二感染動物飼養與實驗操作區、大動物飼養與實驗操作區、籠架清洗、滅菌區及行政區等。
動物飼代養服務開放國內研究人員申請使用,竹南院區潔淨區可飼養囓齒類、兔與犬,生物安全等級二感染區可飼養囓齒類與兔。台南院區潔淨區僅提供小鼠飼代養,生物安全等級二感染區可飼養小鼠或兔。
飼代養服務,從動物訂購、動物接收、動物照護、動物觀察、動物醫療等,採取全方位支援管理模式,有利於研究人員進場利用設施。
於2015年獲得「國際實驗動物管理評鑑及認證協會 (Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care International, AAALAC international) 」授予 「完全認證」 (Full Accreditation) ,積極支援國內生物醫學發展與實驗動物福利。